2022年11月,我室魏绍峰副教授为第一作者,张爱华教授为通讯作者在国际期刊《Ecotoxicology and Environmental Safety》(TOXICOLOGY,中科院1区(TOP),IF=7.129)发表题为“Genome-wide DNA methylation pattern in whole blood of patients with coal-burning arsenic poisoning”的研究论文。该研究得到国家自然科学基金重点项目的支持。
燃煤砷暴露会导致多系统损伤、慢性疾病和癌症的风险增加,而DNA甲基化是砷毒性的潜在机制之一。Illumina850K甲基化珠芯片是最适合用于全表观基因组关联分析的DNA甲基化技术。本研究采用850K检测12例燃煤砷中毒患者(砷中毒组)和4例健康人群对照组(健康对照组)全血全基因组DNA甲基化的变化。结果显示:砷中毒组的全基因组DNA甲基化明显异常,与健康对照组相比,砷中毒组的甲基化位置有647个显著不同,524个甲基化区域不同,335个甲基化基因显著不同。进一步进行基因本体论(GO)和京都基因百科全书(KEGG)进行功能分析,发现砷中毒组与健康对照组之间存在592个GO项目和131条KEGG通路。然后,对基因程度和综合评分进行分析,确定NAPRT1、NT5C3B、NEDD4L、SLC22A3和RAB11B为靶基因。qRT-PCR进一步验证表明,与健康对照组(n=72)相比,砷中毒组(n=72)中5个基因的mRNA表达发生了显著变化。这些结果显示了全基因组甲基化模式,并突出了砷中毒人群中的5个关键基因,它们涉及烟酸盐和烟酰胺代谢、癌症中的胆碱代谢和泛素介导的蛋白质水解。接下来,将进一步挖掘砷中毒的甲基化谱,从5个基因相关途径和功能进一步探讨砷中毒机制。
时间:2022年11月
刊物:Ecotoxicology and Environmental Safety
标题:Genome-wide DNA methylation pattern in whole blood of patients with coal-burning arsenic poisoning